10月10日，约66万美国联邦雇员本应领取工资 ， 但美国政府却拖欠了工资，并开始裁员 。白宫管理和预算办公室主任沃特在社交媒体上宣布联邦政府裁员的消息 。此前，特朗普和白宫官员多次表示，一旦政府停摆就会裁员，且裁员将集中在“趋向民主党的领域” ， 并称民主党人应对此负责 。然而，11日有政府部门承认因“代码出错”裁错了人 。
白宫负责裁员的办公室表示裁员规模“相当可观”，但未透露具体细节 。财政部、卫生与公众服务部、国土安全部等主要部门都证实正在裁员 。据不完全统计 ， 仅7个部门在一天之内就开除了四千多人 。卫生与公众服务部连夜裁员一千多人，但随后又向媒体透露一部分人被裁是“代码出错” ， 这些人最终会收到撤销裁员的通知 。被误裁的人中包括防治麻疹、埃博拉等疾病的流行病学专家，以及负责编写美国各疾病发病率与死亡率每周报告的人员 。这次裁员进一步破坏了美国的传染病防治工作 。
美国教育部也趁机解雇了20%的员工 ， 尤其是负责保障残障儿童教育的机构几乎被清空 。国土安全部则宣布解雇一批负责网络安全和基础设施安全的员工 。特朗普在发布会上表示，裁员以民主党人为主 ， 因为是他们发动了政府停摆 。他还提到，会照顾好自己人，而有些人不值得被照顾 。白宫管理办公室指示联邦机构制定裁员计划时，要求裁掉“与总统的优先事项不一致”的员工或项目 。
美国政府雇员联合会和美国劳工联合会-产业工会联合会对此提起诉讼，请求法院下令终止政府的裁员行为 。下一个发薪日即将到来，10月15日是130万美军的发薪日 。美国众议院议长约翰逊警告说 ， 如果“关门”危机在13日前仍未化解 ， 15日起将不得不拖欠军人薪资 。特朗普表示已命令国防部长使用所有可用资金支付军人薪资，但他没有提到历史上美军薪资本来不受政府停摆影响，两党通常会通过单独法案确保军人工资按时发放 。外媒报道，特朗普政府可能选择挪用军方科研资金以支付军人薪资，但这种做法能否让130万美军按时按量领到工资仍存疑 。

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